Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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