Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAPTM4AQ15012 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms