Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RAB39AQ14964 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 932.5 ms