Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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CHD4Q14839 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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CHD4Q14839 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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CHD4Q14839 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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CHD4Q14839 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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CHD4Q14839 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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CHD4Q14839 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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