Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMCO1Q147U7 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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