Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTTNQ14247 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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