| RUNX2 | Q13950 | CYCSP27-201 | ENST00000527643 | 293 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011611.2-201 | ENST00000549888 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCOCP1-201 | ENST00000554676 | 349 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EGLN3-AS1-201 | ENST00000555922 | 308 nt | TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3941-201 | ENST00000582572 | 103 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC118755.2-201 | ENST00000584676 | 212 nt | TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZRANB2-AS2-213 | ENST00000591654 | 719 nt | TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355073.2-201 | ENST00000612106 | 557 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL442067.2-201 | ENST00000614033 | 363 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HOTAIRM1_5.1-201 | ENST00000619311 | 145 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CDKN3-212 | ENST00000620759 | 196 nt | TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138627.2-201 | ENST00000624202 | 601 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z69720.2-201 | ENST00000624755 | 279 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CUL2-206 | ENST00000421317 | 2376 nt | TSL 2 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BMP5-201 | ENST00000370830 | 3952 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01419-201 | ENST00000522365 | 1521 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF519P1-201 | ENST00000449011 | 1626 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138393.1-203 | ENST00000327086 | 343 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP383-201 | ENST00000362934 | 120 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP374-201 | ENST00000362939 | 125 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA32.2-201 | ENST00000384049 | 122 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD15B-201 | ENST00000384714 | 146 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL32P35-201 | ENST00000415214 | 394 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009161.1-201 | ENST00000417306 | 376 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P10-201 | ENST00000417407 | 739 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PDCL2P1-201 | ENST00000419302 | 352 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL691515.1-201 | ENST00000432976 | 733 nt | TSL 2 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01650-201 | ENST00000438093 | 602 nt | TSL 2 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359771.1-201 | ENST00000441809 | 379 nt | TSL 5 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND3P10-201 | ENST00000450967 | 341 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006445.1-201 | ENST00000491925 | 405 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093523.1-201 | ENST00000503268 | 499 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC098799.2-201 | ENST00000509466 | 868 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-49P-201 | ENST00000516080 | 140 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD19.2-201 | ENST00000516978 | 73 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001783.1-202 | ENST00000534620 | 408 nt | TSL 2 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | APAF1-207 | ENST00000547743 | 651 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00933-203 | ENST00000559812 | 219 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007598.2-201 | ENST00000569490 | 539 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005730.3-201 | ENST00000583067 | 366 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009271.1-202 | ENST00000588803 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011712.1-201 | ENST00000588959 | 234 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012493.2-201 | ENST00000595083 | 291 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005858.4-201 | ENST00000623191 | 700 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR4C15-202 | ENST00000642128 | 951 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF280C-201 | ENST00000370978 | 4634 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNX10-209 | ENST00000619420 | 2361 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FILIP1L-206 | ENST00000471562 | 2854 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMEM59-205 | ENST00000371348 | 1911 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN5-201 | ENST00000358130 | 2126 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FIGNL1-212 | ENST00000613602 | 3187 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1252P-201 | ENST00000363054 | 104 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD67-201 | ENST00000390833 | 111 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-750P-201 | ENST00000390946 | 107 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP354-201 | ENST00000391247 | 136 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1289-1-201 | ENST00000408836 | 144 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.604-201 | ENST00000410574 | 102 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL022329.2-201 | ENST00000413494 | 660 nt | TSL 5 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NDUFB4P5-201 | ENST00000415445 | 361 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009414.1-201 | ENST00000427200 | 443 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL445488.1-202 | ENST00000430623 | 545 nt | TSL 3 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IFNA20P-201 | ENST00000436840 | 528 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359706.1-201 | ENST00000437748 | 315 nt | TSL 3 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC098614.3-201 | ENST00000438957 | 440 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092755.1-201 | ENST00000441746 | 97 nt | TSL 3 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS12P18-201 | ENST00000442381 | 270 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU109.2-201 | ENST00000459316 | 135 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-329P-201 | ENST00000459618 | 107 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC113155.1-201 | ENST00000511141 | 769 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-864P-201 | ENST00000516256 | 108 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.687-201 | ENST00000516558 | 91 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP57-201 | ENST00000517248 | 293 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000763.2-201 | ENST00000540641 | 163 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006199.1-201 | ENST00000548728 | 219 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087045.1-201 | ENST00000605856 | 382 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DAOA-AS1_2.1-201 | ENST00000614829 | 187 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR8057-201 | ENST00000620957 | 69 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR622-201 | ENST00000638396 | 96 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OSTN-202 | ENST00000445281 | 3134 nt | TSL 5 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | QSER1-204 | ENST00000527788 | 5052 nt | TSL 2 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FRS2-201 | ENST00000397997 | 6550 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RTKN2-202 | ENST00000373789 | 6641 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANGPTL1-201 | ENST00000234816 | 3348 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRIF1-203 | ENST00000494675 | 1912 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CBX3P1-201 | ENST00000325243 | 554 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-845P-201 | ENST00000362578 | 103 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-942P-201 | ENST00000363002 | 107 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD113-7-201 | ENST00000363762 | 77 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-767P-201 | ENST00000384132 | 107 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OPRPN-201 | ENST00000399575 | 1040 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6ATAC10P-201 | ENST00000408635 | 111 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LANCL1-AS1-203 | ENST00000433296 | 864 nt | TSL 2 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO2P3-201 | ENST00000442543 | 421 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL671855.1-201 | ENST00000446875 | 1203 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC074033.2-201 | ENST00000480669 | 535 nt | TSL 3 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BMPR1B-AS1-201 | ENST00000510795 | 511 nt | TSL 3 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008871.1-201 | ENST00000510935 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAC1P5-201 | ENST00000512182 | 576 nt | BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UQCRB-202 | ENST00000517523 | 515 nt | TSL 2 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091944.1-201 | ENST00000521984 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |