Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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