Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CDH18Q13634 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CDH18Q13634 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CDH18Q13634 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CDH18Q13634 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDH18Q13634 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDH18Q13634 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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