Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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