Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PRPF4BQ13523 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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