Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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