Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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TCOF1Q13428 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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