Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms