Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NME3Q13232 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms