Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPS1Q13098 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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