Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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