Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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FOXC1Q12948 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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FOXC1Q12948 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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FOXC1Q12948 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXC1Q12948 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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FOXC1Q12948 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXC1Q12948 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXC1Q12948 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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