Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXO1Q12778 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms