Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms