Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRAP18433 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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