Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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