Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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