Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CHCHD4Q8N4Q1 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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