Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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