Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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