Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ALX1Q15699 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms