Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDCD1Q15116 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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