Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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