Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SSPNQ14714 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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