Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms