Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A3Q14050 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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