Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CAPSQ13938 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CAPSQ13938 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CAPSQ13938 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CAPSQ13938 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CAPSQ13938 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CAPSQ13938 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CAPSQ13938 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CAPSQ13938 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CAPSQ13938 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms