Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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