Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1Q13813 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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