Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAMC2Q13753 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMC2Q13753 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms