Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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PTCH1Q13635 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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