Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL3Q13618 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms