Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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HDAC1Q13547 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HDAC1Q13547 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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