Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NME3Q13232 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NME3Q13232 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NME3Q13232 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms