Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CBX3Q13185 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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