Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms