Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RPS29P62273 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPS29P62273 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPS29P62273 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPS29P62273 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPS29P62273 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RPS29P62273 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RPS29P62273 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RPS29P62273 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RPS29P62273 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.7 ms