Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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PTPRMP28827 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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PTPRMP28827 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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PTPRMP28827 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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PTPRMP28827 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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PTPRMP28827 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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PTPRMP28827 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRMP28827 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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