Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.4 ms