Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.34
LRRIQ1Q96JM4 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
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