Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms