Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZBED9Q6R2W3 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms