Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTU2Q2VPK5 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms