Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms